Los paisajes de ADN regulador del ratón revelan los principios globales de la evolución cis-reguladora

Área de la Ciencia:

• Biología evolutiva Biología evolutiva.
• La genómica es la genómica.
• Dinámica del ADN regulatorio de las dinámicas del ADN.

Sus antecedentes:

• Comprender la evolución del ADN regulador es crucial para descifrar la regulación génica y la complejidad del organismo.
• La genómica comparativa proporciona información sobre los mecanismos reguladores conservados y divergentes entre las especies.

Objetivo del estudio:

• Para investigar la dinámica evolutiva del ADN cis-regulador en mamíferos.
• Para comparar paisajes de ADN regulatorio entre los genomas de ratón y humanos.
• Para identificar los mecanismos que impulsan la evolución de la regulación.

Principales métodos:

• Mapeo de más de 1,3 millones de sitios hipersensibles a la desoxirribonucleasa I (DHS) en 45 tipos de células y tejidos de ratón.
• Comparación sistemática de mapas de DHS de ratones con mapas de DHS humanos de regiones genómicas ortólogas.
• Análisis de la rotación y conservación del elemento de reconocimiento del factor de transcripción (TF).

Principales resultados:

• Se observó un extenso recableado cis-regulador entre los genomas de ratón y humano.
• Evidencia de innovación evolutiva específica de la rama y pérdida de elementos regulatorios.
• La reutilización generalizada de DHSs conservados para destinos celulares alternativos.
• El volumen de negocios de los elementos de reconocimiento de TF media la remodelación regulatoria.
• Estricta conservación de la fracción global de las bases de ADN reguladoras que codifican los sitios de reconocimiento de TF dentro de los tipos de células ortólogas.

Conclusiones:

• Los paisajes del ADN regulador de los mamíferos están conformados por una combinación de innovación, pérdida y reutilización de elementos reguladores.
• A pesar de la remodelación extensa, la proporción general de sitios de unión de TF en el ADN regulador se mantiene conservada a lo largo de la evolución de los mamíferos.
• Estos hallazgos ofrecen nuevas perspectivas sobre las fuerzas evolutivas que gobiernan el ADN regulador de los mamíferos.