Caracterización genómica de las rutas hacia la pluripotencia

Área de la Ciencia:

• Biología celular y molecular Biología celular y molecular
• La epigenética y la regulación génica.
• Biología de las células madre Biología de las células madre

Sus antecedentes:

• La reprogramación de las células somáticas a la pluripotencia sigue siendo incompletamente entendida a nivel molecular.
• Falta una caracterización completa de los cambios dinámicos durante la pluripotencia inducida.

Objetivo del estudio:

• Proporcionar una descripción molecular detallada del proceso de reprogramación de los fibroblastos embrionarios de ratón a las células pluripotentes inducidas.
• Para dilucidar la expresión génica distinta, las firmas epigenéticas y los destinos celulares durante la reprogramación.

Principales métodos:

• Generación de extensos conjuntos de datos transcriptómicos, epigenómicos y proteómicos.
• Análisis integrador de datos multi-ómicos para trazar rutas de reprogramación.
• Investigación de la dinámica de la trimetilación de la histona H3 lisina 27 (H3K27me3) y los patrones de metilación del ADN.

Principales resultados:

• Las células pasan por distintos estados moleculares durante la reprogramación.
• La reprogramación se bifurca en estados pluripotentes dependientes y independientes de los transgenes.
• Los eventos tempranos involucran la apertura de la cromatina a través de la pérdida de H3K27me3; los niveles de transgenes dictan la adquisición de destinos pluripotentes similares a la ESC o alternativos.

Conclusiones:

• El estudio proporciona una hoja de ruta molecular completa de la reprogramación de las células somáticas.
• Los resultados de la reprogramación son sensibles a los niveles de factores de transcripción y las modificaciones epigenéticas.
• Los datos son accesibles a través del portal del Proyecto Grandiose para futuras investigaciones.