Sequencia específica, unión de péptido nanomolar a través de cucurbit[8] plegamiento inducido por uril e inclusión de...

Área de la Ciencia:

• Química supramolecular de las moléculas.
• La bioquímica es la bioquímica.
• Reconocimiento molecular.

Sus antecedentes:

• Se sabe que el cucurbit[8]uril (Q8) se une a los péptidos con los residuos aromáticos N-terminales.
• Lograr afinidad y especificidad similares a los anticuerpos en los receptores sintéticos ha sido un desafío de larga data.

Objetivo del estudio:

• Para explorar el reconocimiento molecular de tripeptidos por el cucurbito[8]uril.
• Investigar un nuevo motivo de unión para el reconocimiento mejorado de péptidos.

Principales métodos:

• Cribado de la biblioteca de 105 péptidos utilizando el tetrametilbenzobis (MBBI) como un indicador fluorescente.
• Caracterización utilizando (1) espectroscopia de RMN H, espectrometría de masas de ionización por electrospray y calorimetría de titulación isotérmica.

Principales resultados:

• Descubrimiento de un nuevo modo de unión donde el N-terminal Tyr y los residuos adyacentes se unen dentro de la cavidad Q8.
• Alta afinidad y especificidad para Tyr-Leu-Ala (Kd = 7.2 nM) en comparación con su isómero Tyr-Ala-Leu (Kd = 34 μM).
• MBBI actúa como un sensor de encendido y apagado para la unión de péptidos.

Conclusiones:

• Cucurbit[8]uril exhibe un reconocimiento molecular excepcional para tripeptidos específicos.
• El motivo de unión descubierto y la alta afinidad presentan oportunidades para aplicaciones bioquímicas y biotecnológicas.
• La estabilidad, la rentabilidad y la compatibilidad del sistema con proteínas recombinantes mejoran su utilidad práctica.