Predisposición genética al neuroblastoma mediada por un polimorfismo del superpotenciador LMO1

Área de la Ciencia:

• La genética
• En el campo de la oncología
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• El neuroblastoma es un cáncer infantil común que se origina en el sistema nervioso simpático.
• La tumorigénesis involucra factores genéticos, con polimorfismos del locus LMO1 previamente relacionados con la susceptibilidad al neuroblastoma.
• Comprender la variante causal y su mecanismo es crucial para las terapias dirigidas.

Objetivo del estudio:

• Identificar la variante específica del ADN en el locus LMO1 responsable de la susceptibilidad al neuroblastoma.
• Para aclarar el mecanismo molecular por el cual esta variante contribuye a la tumorigénesis.
• Investigar el papel de la unión del factor de transcripción y la modulación de la expresión génica.

Principales métodos:

• Imputación de genotipos en el locus LMO1.
• Mapeo de los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) a los elementos reguladores.
• Análisis de la accesibilidad de la cromatina, la conservación evolutiva y los sitios de unión del factor de transcripción.
• Secuenciación de ARN y análisis de reporteros para evaluar la expresión génica y el desequilibrio alélico.

Principales resultados:

• SNP rs2168101 G>T fue identificada como la variante más significativamente asociada.
• Este SNP se encuentra dentro de un super potenciador en el primer intrón de LMO1.
• El alelo G ancestral, vinculado a la formación de tumores, se une a los factores de transcripción GATA, mientras que el alelo T protector elimina la unión y reduce la expresión de LMO1.
• Se observó un desequilibrio alélico que favorecía el alelo G en los tumores.

Conclusiones:

• Un polimorfismo recientemente desarrollado en un super potenciador LMO1 influye en la susceptibilidad al neuroblastoma.
• La unión diferencial al factor de transcripción GATA y la regulación cis de la expresión de LMO1 subyacen a este efecto.
• Los hallazgos ponen de relieve un mecanismo de adicción oncogénica impulsado por la variación genética en los elementos reguladores.