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Updated: Mar 27, 2026

Determining the Likelihood of Variant Pathogenicity Using Amino Acid-level Signal-to-Noise Analysis of Genetic Variation
Published on: January 16, 2019
Asociación de variantes genéticas relacionadas con la arritmia con fenotipos documentados en registros médicos
Sara L Van Driest1, Quinn S Wells1, Sarah Stallings1
1Vanderbilt University Medical Center, Nashville, Tennessee.
Se encontraron variantes raras en los genes de arritmia SCN5A y KCNH2 en el 11% de los individuos. Sin embargo, estas variantes genéticas no mostraron una clara asociación con los fenotipos de arritmia cardíaca en esta población de estudio.
Área de la Ciencia:
- La genética
- Cardiología
- Farmacogenómica
Sus antecedentes:
- La secuenciación de ADN a gran escala con frecuencia identifica variantes raras en los genes de la enfermedad mendeliana.
- La relevancia clínica de estos hallazgos incidentales en poblaciones no seleccionadas no está clara.
- Los registros médicos electrónicos (EMR) ofrecen un recurso potencial para evaluar los fenotipos clínicos asociados con las variantes raras.
Objetivo del estudio:
- Investigar los fenotipos clínicos asociados con las variantes patógenas en los genes de susceptibilidad a la arritmia (SCN5A y KCNH2).
- Determinar la frecuencia de los fenotipos cardíacos en individuos portadores de estas variantes utilizando los datos de la REM.
Principales métodos:
- Se realizó un estudio prospectivo de cohorte de 2022 personas.
- Las variantes en SCN5A y KCNH2 fueron evaluadas para la patogenicidad por laboratorios expertos y ClinVar.
- Los fenotipos se identificaron a través de los códigos de la CIE-9, los datos del ECG y la revisión manual de la EMR.
Principales resultados:
- El 11% de los participantes llevaba variantes raras en SCN5A o KCNH2.
- 42 variantes en 63 individuos fueron consideradas potencialmente patógenas, con baja concordancia interlaboratorial.
- No se encontró una asociación significativa entre la presencia de estas variantes y los fenotipos de arritmia o ECG, incluida la duración corregida del intervalo QT.
Conclusiones:
- Hay poca concordancia entre los laboratorios en la clasificación de las variantes SCN5A y KCNH2 como patógenas.
- Las variantes genéticas putativamente patógenas en estos genes de arritmia no se asociaron con fenotipos anormales en una población no seleccionada.
- Estos hallazgos cuestionan la utilidad clínica de notificar a los pacientes sobre hallazgos genéticos incidentales de susceptibilidad a la arritmia.
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