Term-seq revela abundante ribo-regulación de la resistencia a los antibióticos en las bacterias

Área de la Ciencia:

• Regulación genética bacteriana
• Biología del ARN
• Resistencia a los antimicrobianos

Sus antecedentes:

• Los riboswitches y los atenuadores son elementos de ARN cis-reguladores que controlan la expresión génica bacteriana.
• Estos elementos suelen mediar la terminación prematura de la transcripción en respuesta a la unión del metabolito.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un método imparcial de todo el genoma para descubrir ribo-reguladores bacterianos.
• Crear una plataforma para la cuantificación de la actividad in vivo y el cribado de reguladores sensibles a los metabolitos.

Principales métodos:

• Descubrimiento experimental de ribo-reguladores en todo el genoma.
• Plataforma de medición y detección de actividad in vivo de alto rendimiento.
• Estudio mecanicista detallado de un regulador específico en Listeria monocytogenes.

Principales resultados:

• Identificó numerosos ribo-reguladores que responden a los antibióticos en los patógenos y el microbioma humano.
• Caracterizó un mecanismo de atenuación que involucra a los ribosomas estancados por antibióticos en Listeria monocytogenes.
• Se han demostrado funciones amplias para la terminación condicional en la regulación de la resistencia a los antibióticos.

Conclusiones:

• La terminación condicional juega un papel importante en la regulación de la resistencia a los antibióticos.
• El enfoque desarrollado sirve como una herramienta valiosa para descubrir nuevos riboswitches y atenuadores con diversas especificidades de ligandos.