Los SRMAtlas humanos: un recurso de ensayos dirigidos para cuantificar el proteoma humano completo

Área de la Ciencia:

• Proteomía
• La bioquímica
• Biología de sistemas

Sus antecedentes:

• Comprender el proteoma humano es crucial para descifrar las funciones celulares y los mecanismos de la enfermedad.
• Los métodos existentes para la cuantificación de proteínas a menudo son limitados en alcance, especificidad o accesibilidad.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un recurso completo para cuantificar casi todas las proteínas humanas.
• Permitir mediciones fiables y reproducibles de proteínas en diversas muestras biológicas.

Principales métodos:

• Generación y verificación de un compendio de ensayos muy específicos.
• Se utilizó la espectrometría de masas dirigida, monitoreo de reacción específicamente seleccionado (SRM), para la cuantificación de proteínas.
• Desarrolló el SRMAtlas humano, proporcionando coordenadas definitivas para la identificación del péptido.

Principales resultados:

• Ensayos de cuantificación para el 99,7% de las 20 277 proteínas humanas anotadas.
• Los datos incluyen 166.174 péptidos proteotípicos, ofreciendo múltiples ensayos por proteína.
• Los ensayos pueden identificar variantes empalmadas, mutaciones y modificaciones posteriores a la traducción.
• Utilidad demostrada en el estudio de las respuestas celulares a la inhibición de la síntesis de colesterol y al tratamiento con docetaxel.

Conclusiones:

• El SRMAtlas humano es un recurso valioso y de libre acceso para la investigación proteómica.
• Permite la cuantificación integral de proteínas, el avance de la biología de sistemas y la investigación de enfermedades.
• Facilita una comprensión más profunda de las redes celulares y las respuestas terapéuticas.