Estructura de la ent-Copalyl Diphosphate Synthase PtmT2 de Streptomyces platensis CB00739, una Diterpene Synthase...

Área de la Ciencia:

• La bioquímica
• Biología estructural
• Productos naturales Química

Sus antecedentes:

• Los terpenoides son productos naturales diversos, y la biosíntesis de terpenoides bacterianos está siendo subestimada.
• Las terpenas sintasas (TSs) catalizan la formación del esqueleto terpenoide a través de cascadas de ciclización.
• La evolución estructural de las TS, particularmente las DTS bacterianas de tipo II, sigue siendo incompleta.

Objetivo del estudio:

• Para determinar la primera estructura cristalina de una bacteria tipo II DTS.
• Aclarar el mecanismo catalítico y el papel evolutivo de las DTS bacterianas de tipo II.

Principales métodos:

• Cristalografía de rayos X de PtmT2 de Streptomyces platensis CB00739 con una resolución de 1,80 Å.
• Estudios de acoplamiento molecular para modelar la unión al sustrato.
• Mutagénesis dirigida al sitio para identificar los principales residuos catalíticos.

Principales resultados:

• Se resolvió la estructura cristalina de PtmT2, una ent-copalil difosfato sintasa.
• El acoplamiento sugiere que el difosfato de geranilgeranilo (GGPP) se une en una conformación catalíticamente activa.
• La mutagenesis identificó residuos de unión al difosfato de GGPP y un posible motivo de unión al Mg2+ (DxxxxE).

Conclusiones:

• La estructura de PtmT2 proporciona información crítica sobre los mecanismos DTS del tipo II de las bacterias.
• Este trabajo llena un vacío en la comprensión de la evolución estructural TS de los antepasados bacterianos.
• Las propiedades del sitio activo dictan la especificidad catalítica de TS, avanzando el conocimiento de TS bacterianos.