Análisis de la variación genética que codifica las proteínas en 60.706 seres humanos

Área de la Ciencia:

• La genómica
• La genética humana
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• La interpretación de los cambios en la secuencia de ADN requiere datos completos de variación genética humana.
• Los conjuntos de datos anteriores carecían de la escala y la diversidad para un análisis sólido.

Objetivo del estudio:

• Para agregar y analizar datos de secuencia de ADN de exoma de alta calidad de una cohorte grande y diversa.
• Crear un catálogo de referencia de la diversidad genética humana para la interpretación de las variantes y los estudios de la función génica.

Principales métodos:

• Recogió y analizó datos de secuenciación de exomas de 60,706 individuos.
• Métodos desarrollados para calcular la patogenicidad de las variantes e identificar los genes bajo selección.
• Catalogado la diversidad genética humana y los patrones de recurrencia mutacional.

Principales resultados:

• Generó un catálogo de variación genética humana con un promedio de una variante cada ocho bases.
• Se identificaron 3,230 genes con agotamiento casi completo de las variantes de truncamiento de proteínas previstas.
• Utilidad demostrada para filtrar las variantes candidatas de la enfermedad y descubrir las variantes knockout humanas.

Conclusiones:

• El conjunto de datos del Exome Aggregation Consortium (ExAC) es un recurso valioso para la investigación genética humana.
• El catálogo facilita las métricas objetivas de patogenicidad y la identificación de genes funcionalmente importantes.
• Estos datos permiten un filtrado eficiente de variantes y el descubrimiento de nocauts genéticos humanos.