El paisaje epigenético del agotamiento de las células T

Área de la Ciencia:

• Inmunología
• La epigenética
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• Las células T agotadas en cáncer e infecciones crónicas exhiben una expresión génica distinta, incluida la expresión de la proteína de muerte celular programada sostenida 1 (PD-1).
• Los mecanismos reguladores que rigen la expresión génica en las células T agotadas siguen siendo en gran medida desconocidos.

Objetivo del estudio:

• Para delinear el paisaje de cromatina accesible en las células T CD8+ agotadas.
• Para identificar las diferencias epigenéticas entre las células T CD8 + de memoria agotadas y funcionales.
• Para entender la regulación de la expresión de PD-1 en el agotamiento de las células T.

Principales métodos:

• Perfiles de accesibilidad de la cromatina en células T CD8+ agotadas de humanos y ratones.
• Análisis comparativo de paisajes epigenéticos entre células T de memoria agotadas y funcionales.
• Edición del genoma para investigar la función del potenciador y la regulación genética.

Principales resultados:

• El paisaje de cromatina accesible de las células T CD8+ agotadas es distinto del de las células T CD8+ de memoria funcional.
• Las células T agotadas desarrollan un paisaje epigenético específico del estado con módulos potenciadores organizados.
• Un potenciador específico para el agotamiento, que contiene motivos RAR, T-bet y Sox3, regula parcialmente la expresión de PD-1.

Conclusiones:

• Las alteraciones epigenéticas definen el estado agotado de las células T.
• Los mapas de potenciadores funcionales proporcionan información sobre el agotamiento de las células T.
• La orientación de potenciadores específicos de agotamiento a través de la edición del genoma puede modular la expresión génica en las células T agotadas.