Los impulsores genéticos de la variación epigenética y transcripcional en las células inmunes humanas

Área de la Ciencia:

• La genética humana
• Inmunología
• Biología de sistemas

Sus antecedentes:

• Comprender las contribuciones genéticas y epigenéticas a las enfermedades es crucial.
• La función de las células inmunes es clave para muchas enfermedades complejas.
• Se necesitan datos multiómicos de alta resolución para diseccionar estas relaciones.

Objetivo del estudio:

• Evaluar cuantitativamente las contribuciones cisgenéticas y epigenéticas a la transcripción génica en las células inmunes.
• Evaluar los posibles factores de confusión en los estudios de asociación de todo el epigenoma.
• Caracterizar los efectos genéticos coordinados a través de la expresión génica, la metilación y la variación de las histonas.

Principales métodos:

• Perfil genético, epigenético y transcriptómico de alta resolución.
• Análisis de los monocitos CD14+, los neutrófilos CD16+ y las células T CD4+ ingenuas.
• Mapeo cuantitativo del locus del rasgo (QTL) y análisis específicos del alelo (AS).

Principales resultados:

• Perfiles detallados de tres tipos principales de células inmunes humanas de 197 individuos.
• Evaluación cuantitativa de las contribuciones de los factores cisgenéticos y epigenéticos a la transcripción.
• Identificación de 345 loci únicos de enfermedades inmunes con QTL de rasgos moleculares colocalizados.

Conclusiones:

• Un extenso atlas multiómico de alta resolución proporciona información sobre las correlaciones moleculares específicas del tipo de célula.
• Correlaciones identificadas entre insumos genómicos y eventos moleculares que influyen en el riesgo de enfermedades complejas.
• El estudio define los fundamentos moleculares de la susceptibilidad a enfermedades complejas.