Secuencia del genoma y diversidad genética de los fresnos europeos

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Patología vegetal
• Sector forestal

Sus antecedentes:

• Los árboles de ceniza (Fraxinus) se enfrentan a la devastación por el dieback de ceniza (Hymenoscyphus fraxineus) en Europa y el perforador de ceniza esmeralda (Agrilus planipennis) en América del Norte.
• Comprender la genética del árbol de ceniza es crucial para desarrollar estrategias para combatir estas amenazas.

Objetivo del estudio:

• Secuenciar y anotar el genoma de Fraxinus excelsior para identificar los factores genéticos que influyen en la susceptibilidad al dieback.
• Desarrollar marcadores genéticos mejorados para la resistencia a las enfermedades y evaluar su prevalencia en las poblaciones de cenizas británicas.

Principales métodos:

• Secuenciación del genoma y anotación de un árbol de Fraxinus excelsior.
• Análisis genómico comparativo con otras diez especies de plantas.
• Re-secuenciación de 37 árboles de F. excelsior y análisis genético de poblaciones.
• Reanálisis de los datos transcriptómicos de asociación para identificar los marcadores de resistencia.
• Encuesta sobre la prevalencia de marcadores en las poblaciones británica y danesa.

Principales resultados:

• Anotó 38,852 genes codificadores de proteínas, con el 25% identificado como específico de la ceniza.
• La evidencia sugiere un evento compartido de duplicación de todo el genoma con Olea europaea.
• Se han identificado marcadores genéticos mejorados para reducir la susceptibilidad al dieback de las cenizas.
• Se encontró una distribución potencialmente más amplia de susceptibilidad reducida en Gran Bretaña en comparación con Dinamarca.
• Susceptibilidad del árbol al Hymenoscyphus fraxineus relacionada con los niveles de glucósidos iridoides.

Conclusiones:

• El genoma de Fraxinus excelsior proporciona un recurso valioso para comprender la biología del árbol de ceniza y la resistencia a las enfermedades.
• Los marcadores genéticos identificados ofrecen potencial para la cría de árboles de ceniza más resistentes.
• La reducción de la susceptibilidad a la muerte de las cenizas puede ser más frecuente en Gran Bretaña, lo que ofrece esperanzas para los esfuerzos de mitigación.