Modelo estructural del conjunto tubular de la proteína de la cápside del virus del sarcoma de Rous

Área de la Ciencia:

• Biología estructural
• Virología
• La biofísica

Sus antecedentes:

• La proteína de la cápside ortorretroviral (CA) forma cápsidas polimórficas, con su arquitectura, ensamblaje y estabilidad siendo áreas de investigación activa.
• CA consta de dominios N-terminales (NTD) y C-terminales (CTD) que median las interacciones homotípicas y heterotípicas, formando torretas hexámicas en la superficie de la cápside.

Objetivo del estudio:

• Para determinar las asignaciones de resonancia de RMN de estado sólido casi completas del virus del sarcoma de Rous (RSV) CA ensamblado en tubos hexámeros.
• Establecer un modelo de resolución atómica del conjunto tubular RSV CA y dilucidar los mecanismos que impulsan la curvatura de la cápside.

Principales métodos:

• RMN en estado sólido (RMNSS) para las asignaciones de resonancia de tubos hexámeros CA RSV ensamblados.
• Microscopía crioelectrónica (crio-EM) para las restricciones estructurales.
• Simulaciones de ajuste flexible de dinámica molecular (MDFF) para construir un modelo de resolución atómica.

Principales resultados:

• Las asignaciones de ssNMR revelaron cambios conformacionales significativos en los bucles y la hélice iniciadora de CTD al ensamblar, con un enlace interdominio estáticamente desordenado.
• El modelo MDFF, combinado con datos ssNMR y cryo-EM, mostró que la curvatura de la cápside surge de las interfaces reconfiguradas NTD-CTD y CTD.
• La variabilidad en las interfaces de dímeros y trímeres de CTD, junto con el enlace H generalizado, contribuye a la maleabilidad y la deformación de la red hexámica de CA.

Conclusiones:

• La curvatura de la cápside en RSV es inducida principalmente por la reconfiguración de las interfaces entre dominios, impulsada por el desplazamiento variable de los CTD alrededor de las torres hexámicas de NTD.
• Las diferencias en los ángulos de contacto helicoidal entre los conjuntos de CA de VIH y RSV sugieren distintas vías de ensamblaje de cápsidas.