La cohesina se coloca en los genomas de los mamíferos por transcripción, CTCF y Wapl

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• La epigenética

Sus antecedentes:

• Los genomas de los mamíferos están organizados en bucles de cromatina y dominios topológicamente asociados por CTCF y cohesión.
• Los sitios de unión de CTCF son cruciales para las interacciones cromosómicas de largo alcance mediadas por la cohesina, pero los mecanismos de reclutamiento de la cohesina siguen sin estar claros.

Objetivo del estudio:

• Investigar los factores que rigen la distribución de la cohesión en el genoma de los mamíferos.
• Para aclarar los roles de la transcripción, CTCF y Wapl en la dinámica de la cohesión y la localización.

Principales métodos:

• Se utilizaron fibroblastos de ratón empobrecidos por CTCF para observar el comportamiento de la cohesión.
• Se analizó la distribución de la cohesión en ausencia de CTCF y Wapl.
• Investigó el impacto de la expresión génica alterada en la localización de la cohesión.

Principales resultados:

• La cohesina no se recluta a los sitios CTCF en las células agotadas de CTCF, sino que se acumula en los sitios de inicio de la transcripción génica activa.
• En ausencia de CTCF y Wapl, la cohesión forma "islas" en los extremos 3' de los genes activos, influenciados por los niveles de expresión génica.
• Se observó una translocación mediada por la transcripción de la cohesina en largas distancias de ADN, similar a la levadura.

Conclusiones:

• La transcripción juega un papel clave en la reubicación de la cohesión de los mamíferos, contribuyendo a su posicionamiento en los sitios CTCF.
• Los genes activos pueden liberarse de la cohesina a través de la translocación mediada por transcripción o la liberación mediada por Wapl, lo que afecta la regulación génica.