El perfil de las interacciones de la cadena naciente de ssb revela los principios del plegado asistido por Hsp70

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Biología celular
• La bioquímica

Sus antecedentes:

• El chaperón Hsp70 Ssb en la levadura juega un papel crucial en el plegamiento de proteínas al interactuar con los ribosomas y los polipéptidos nacientes.
• Comprender su mecanismo preciso es clave para comprender el procesamiento de proteínas co-traductivas.

Objetivo del estudio:

• Esclarecer el principio de funcionamiento de Ssb mediante la determinación de su patrón de unión en cadena naciente a una resolución casi residual.
• Investigar el papel de Ssb en el plegamiento de proteínas, la dinámica de traducción y la orientación de proteínas organellares.

Principales métodos:

• Se empleó perfiles selectivos de ribosomas in vivo para mapear las interacciones de Ssb con los polipéptidos nacientes.
• Análisis de las densidades de huella ribosómica a lo largo de los marcos de lectura abiertos (ORF) para evaluar la velocidad de traducción.

Principales resultados:

• Ssb se asocia ampliamente con las proteínas citosólicas, nucleares, mitocondriales y ER nacientes, lo que indica una función general de chaperón.
• Ssb involucra sustratos a través de múltiples ciclos de enlace-liberación con un motivo rico en aminoácidos cargados y aromáticos.
• El complejo asociado al ribosoma (RAC) es necesario para la asociación de Ssb, pero el complejo asociado al polipéptido naciente (NAC) no lo es.
• La unión de Ssb se correlaciona con una traducción más rápida, influenciada por la estructura del ARNm, el uso de codones y la acción de Ssb.

Conclusiones:

• Ssb utiliza interacciones dinámicas y adaptadas al sustrato para manejar el plegamiento de proteínas co-traductivas.
• Ssb facilita la traducción acelerada y apoya la focalización en la membrana de las proteínas organellares.