Expansión reguladora en mamíferos de ensamblajes hnRNP multivalentes que controlan globalmente el empalme alternativo

Área de la Ciencia:

• Biología evolutiva
• Biología molecular
• La genética

Sus antecedentes:

• Los patrones de empalme alternativo (AS) divergen rápidamente durante la evolución de los vertebrados.
• Las funciones de la mayoría de los eventos de empalme específicos de especies y linajes siguen siendo en gran medida desconocidas.
• Las regiones intrínsecamente desordenadas (IDR) son cruciales para la función y la regulación de las proteínas.

Objetivo del estudio:

• Investigar la importancia funcional de los eventos de SA específicos de los mamíferos.
• Aclarar el papel de la AS en las interacciones proteína-proteína y la regulación génica.
• Comprender la expansión evolutiva de los mecanismos reguladores en las células de los mamíferos.

Principales métodos:

• Análisis de patrones de empalme alternativos en los genomas de los mamíferos.
• Identificación de los eventos AS específicos de la especie.
• Investigación de las interacciones ARN-proteína y la formación de complejos.
• Estudios funcionales sobre el impacto de la AS en los conjuntos de proteínas y la regulación del empalme.

Principales resultados:

• Los eventos AS específicos de los mamíferos se enriquecen en regiones de proteínas que codifican regiones intrínsecamente desordenadas (IDR).
• Estos eventos afectan a las familias de proteínas de unión al ARN (hnRNP A y D) e implican repeticiones de glicina / tirosina.
• La inclusión diferencial de exones controla los conjuntos de hnRNP multivalentes dependientes de la tirosina.
• La regulación requiere duplexos de ARN inusuales y específicos para mamíferos de largo alcance.

Conclusiones:

• El control AS de las interacciones mediadas por IDR entre los hnRNP es un mecanismo regulador clave de empalme.
• Este mecanismo ha ampliado la capacidad reguladora de las células de mamíferos.
• Los cambios evolutivos en el SA contribuyen a nuevas funciones reguladoras y potencialmente a enfermedades humanas.