Los inhibidores alostéricos, la cristalografía y el análisis comparativo revelan una red de movimiento coordinado entre las proteasas del virus del herpes humano

Área de la Ciencia:

• La bioquímica
• Biología estructural
• Virología

Sus antecedentes:

• Dirigirse a sitios de unión crípticos es una estrategia poco explorada para el desarrollo de fármacos de moléculas pequeñas.
• La proteasa dimérica (Pr) del herpesvirus asociado al sarcoma de Kaposi (KSHV) es un objetivo clave para las terapias antivirales.

Objetivo del estudio:

• Investigar la red alostérica que une un sitio de interfaz de dimerización críptica con la función de la proteasa KSHV.
• Para dilucidar el mecanismo de inhibición por los inhibidores alostéricos dirigidos a este sitio críptico.

Principales métodos:

• Se determinaron cinco estructuras criogénicas de rayos X de la proteasa monomérica KSHV con inhibidores alostéricos unidos.
• Se analizaron los datos de rayos X a temperatura ambiente y se compararon las estructuras con otras proteasas del herpesvirus dimérico.
• Se realizaron análisis cinéticos detallados para dilucidar el mecanismo de inhibición.

Principales resultados:

• Se identificaron distintos movimientos coordinados asociados con la unión del inhibidor alostérico en la interfaz del dímero.
• Elucidado un mecanismo de inhibición de dos pasos, lo que sugiere un modelo de isomerización de la enzima.
• Se demostró la eficacia de un inhibidor alostérico representativo en un modelo celular de infectividad por KSHV.

Conclusiones:

• Descubrió una red dinámica coordinada que vincula la ocupación del sitio de unión críptico con la inactivación alosterica de la proteasa KSHV.
• Este mecanismo de inhibición alostérica puede ser explotado para atacar otras proteasas del herpesvirus clínicamente relevantes.