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Protein Folding01:22

Protein Folding

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Overview
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Protein Folding01:25

Protein Folding

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Proteins are chains of amino acids linked together by peptide bonds. Upon synthesis, a protein folds into a three-dimensional conformation, critical to its biological function. Interactions between its constituent amino acids guide protein folding, and hence the protein structure is primarily dependent on its amino acid sequence.
Protein Structure Is Critical to Its Biological Function
Proteins perform a wide range of biological functions such as catalyzing chemical reactions, providing...
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Intrinsically Disordered Proteins02:18

Intrinsically Disordered Proteins

20.2K
Intrinsically disordered proteins are a group of proteins that do not fold into specific three-dimensional structures. Their structural flexibility allows them to complement ordered proteins to perform functions that are inaccessible to rigid structures. They are more common in eukaryotes than prokaryotes and may either be exclusively intrinsically disordered or hybrid proteins, consisting of a mix of ordered and disordered regions. The absence of a rigid structure in these proteins can be...
20.2K
¹H NMR of Conformationally Flexible Molecules: Temporal Resolution00:52

¹H NMR of Conformationally Flexible Molecules: Temporal Resolution

1.3K
At room temperature, the chair conformer of cyclohexane undergoes rapid ring flipping between two equivalent chair conformers at a rate of approximately 105 times per second. These two chair conformers are in equilibrium. The rapid ring flipping results in the interconversion of the axial proton to an equatorial proton and an equatorial to the axial proton. Such interconversions are too rapid and cannot be detected on the NMR timescale. Hence, the NMR spectrometer cannot distinguish between the...
1.3K
Molecular Chaperones and Protein Folding03:00

Molecular Chaperones and Protein Folding

20.2K
The native conformation of a protein is formed by interactions between the side chains of its constituent amino acids. When the amino acids cannot form these interactions, the protein cannot fold by itself and needs chaperones. Notably, chaperones do not relay any additional information required for the folding of polypeptides; the native conformation of a protein is determined solely by its amino acid sequence. Chaperones catalyze protein folding without being a part of the folded protein.
The...
20.2K
¹H NMR of Conformationally Flexible Molecules: Variable-Temperature NMR01:15

¹H NMR of Conformationally Flexible Molecules: Variable-Temperature NMR

1.7K
The axial and equatorial protons in cyclohexane can be distinguished by performing a variable-temperature NMR experiment. In this process, except for one proton, the remaining eleven protons are replaced by deuterium. The deuterium substitution avoids the possible peak splitting caused by the spin-spin coupling between the adjacent protons. The remaining proton flips between the axial and equatorial positions.
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  2. Estructura Y Dinámica De Una Región De Proteína Intrínsecamente Desordenada Que Se Pliega Parcialmente Al Unirse Por Nmr De Intercambio Químico
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Author Spotlight: Exploring Intrinsically Disordered Protein Dynamics Through NMR Relaxation Experiments

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Estructura y dinámica de una región de proteína intrínsecamente desordenada que se pliega parcialmente al unirse por

Cyril Charlier1,2, Guillaume Bouvignies1,2, Philippe Pelupessy1,2

  • 1Laboratoire des Biomolécules, Département de chimie, École normale supérieure, UPMC Université Paris 06, CNRS, PSL Research University , 24 rue Lhomond, Paris 75005, France.

Journal of the American Chemical Society
|August 8, 2017

Ver abstracta en PubMed

Resumen
Este resumen es generado por máquina.

Este estudio introduce un nuevo método de RMN para estudiar cómo se pliegan las proteínas intrínsecamente desordenadas (IDP) al unirse. La técnica caracteriza tanto las regiones ordenadas como las desordenadas en los complejos de proteínas, ayudando a comprender su estructura y dinámica.

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Área de la Ciencia:

  • Bioquímica y biología estructural
  • Dinámica y interacciones de las proteínas
  • Espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN)

Sus antecedentes:

  • Las proteínas intrínsecamente desordenadas (IDP) y las regiones (IDR) interactúan transitoriamente con las parejas, a menudo experimentando un plegamiento parcial.
  • Caracterizar estos estados parcialmente plegados es difícil con métodos tradicionales como la RMN y la cristalografía de rayos X.

Objetivo del estudio:

  • Desarrollar un método simple basado en RMN para caracterizar tanto las regiones ordenadas como las desordenadas en los complejos de proteínas que involucran PDI.
  • Investigar las propiedades estructurales y dinámicas de los IDR en su estado unido.

Principales métodos:

  • Se utilizó el monitoreo de intercambio químico de RMN para estudiar las IDR que se pliegan al unirse.
  • Restricciones estructurales obtenidas a partir de desplazamientos químicos y dinámicas específicas del sitio a partir de las tasas de relajación en el estado ligado.
  • Aplicó el método al complejo Artemis-Ligase IV.
  • Principales resultados:

    • Determinado con éxito la conformación del IDR interactuando y acoplado a la pareja plegada.
    • Reproducido los datos cristalográficos para el núcleo complejo e identificado una interfaz más amplia.
    • Demostró la aplicabilidad del método a complejos de proteínas desordenadas y plegadas.

    Conclusiones:

    • El enfoque de RMN desarrollado proporciona una forma sólida de investigar la estructura y la dinámica de los complejos proteicos que involucran a los PDI.
    • Este método supera las limitaciones de las técnicas existentes para el estudio de IDR parcialmente plegados.
    • Los hallazgos son ampliamente aplicables a los estudios biofísicos de las interacciones proteína-proteína que involucran proteínas desordenadas.