Genómica clínica integrada del cáncer metastásico

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La genómica
• Biología del cáncer

Sus antecedentes:

• La metástasis es la principal causa de mortalidad por cáncer.
• Existen datos moleculares completos limitados para los cánceres metastásicos adquiridos clínicamente en comparación con los tumores primarios.

Objetivo del estudio:

• Para realizar la secuenciación de todo el exoma y el transcriptoma en una gran cohorte de tumores sólidos metastásicos.
• Identificar las alteraciones genéticas somáticas y de línea germinal prevalentes en los cánceres metastásicos.
• Caracterizar el paisaje molecular y el microambiente de los tumores metastásicos.

Principales métodos:

• Secuenciación del exoma entero y del transcriptoma entero de 500 pacientes adultos con tumores sólidos metastásicos.
• Análisis de las alteraciones genéticas somáticas, incluidas TP53, CDKN2A, PTEN, PIK3CA y RB1.
• Identificación de las variantes de la línea germinal, en particular las que afectan a las vías de reparación del ADN.
• Secuenciación de ARN para la detección de la fusión génica, la activación de la vía y el perfil inmunológico.

Principales resultados:

• Las alteraciones somáticas prevalentes identificadas en TP53, CDKN2A, PTEN, PIK3CA y RB1.
• Las variantes patógenas de la línea germinal se encontraron en el 12,2% de los casos, con el 75% vinculado a defectos de reparación del ADN.
• La secuenciación de ARN reveló fusiones de genes, vías activadas y firmas inmunes.

Conclusiones:

• El análisis integrador de secuencias proporciona una visión multidimensional y clínicamente relevante de los cánceres metastásicos.
• Comprender el paisaje molecular y el microambiente es crucial para atacar la enfermedad metastásica.
• Este estudio amplía la comprensión molecular de diversos tumores sólidos metastásicos.