Descubrimiento de potenciadores inmunológicos con respuesta a la estimulación con activación de CRISPR

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Inmunología
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• La mayoría de las variantes genéticas de enfermedades comunes afectan a los potenciadores, que controlan la expresión génica.
• Comprender la función del potenciador es clave para descifrar el papel del ADN no codificante en la enfermedad.
• Los métodos actuales para mapear potenciadores están limitados por el contexto celular.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar una plataforma para la identificación de potenciadores de respuesta al estímulo independientemente de la exposición al estímulo.
• Investigar el papel de los potenciadores en los loci de riesgo de autoinmunidad (CD69 e IL2RA).

Principales métodos:

• Utilizó la activación tiled de CRISPR (CRISPRa) para activar sintéticamente potenciadores en grandes regiones genómicas.
• Se emplearon modelos de ratón diseñados para estudiar la función del potenciador in vivo.
• Características de la cromatina analizadas y cambios en la expresión génica en respuesta a la perturbación del potenciador.

Principales resultados:

• Se identificaron varios elementos receptivos a CRISPR con características de potenciadores de la respuesta al estímulo.
• Descubrió un potenciador de IL2RA que alberga una variante de riesgo de autoinmunidad.
• Demostró que perturbar el potenciador Il2ra asociado a la enfermedad retrasó, en lugar de bloquear, la activación génica y la diferenciación sesgada de las células T.

Conclusiones:

• La plataforma CRISPRa identifica eficazmente los potenciadores funcionales que responden al estímulo.
• Las variantes no codificantes en los potenciadores pueden alterar el tiempo de regulación génica y la función de las células inmunes.
• Este trabajo proporciona información sobre la base genética de la disfunción inmune y la autoinmunidad.