Un recurso de biobanco de células madre embrionarias de ratón haploide reversible para la genómica funcional

Área de la Ciencia:

• La genética
• Biología de las células madre
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• La investigación de la genómica funcional es esencial, pero a menudo se ve obstaculizada por la variación clonal en las poblaciones celulares.
• La reproducibilidad en los estudios biológicos es un desafío significativo debido a la heterogeneidad celular inherente.

Objetivo del estudio:

• Establecer un recurso completo para la anotación funcional del genoma.
• Desarrollar un método que supere la varianza clonal para las pruebas genéticas de alto rendimiento.
• Identificar nuevos genes involucrados en procesos celulares esenciales, angiogénesis e infecciones virales.

Principales métodos:

• Se empleó mutagenesis saturada por genoma para generar un biobanco de más de 100.000 líneas celulares embrionarias haploides de ratón (mES).
• Cada línea celular presenta mutaciones genéticamente codificadas, condicionales y reversibles dirigidas a 16.970 genes.
• Se utilizó la mutagénesis reversible para permitir la anotación funcional directa en las células hermanas, mitigando la varianza clonal.

Principales resultados:

• Se creó y puso a disposición de los investigadores el Haplobank, un recurso de células mES hemi/homocigotas mutantes.
• Las pantallas genéticas inversas que utilizan el Haplobank identificaron genes que regulan los procesos esenciales en las células mES, la angiogénesis germinativa y la especificación del linaje de los vasos sanguíneos.
• Una pantalla delantera de todo el genoma identificó PLA2G16 como un factor huésped crucial para la citotoxicidad inducida por el rinovirus.

Conclusiones:

• El Haplobank combinado con la tecnología de mutagénesis reversible proporciona una poderosa plataforma para la anotación del genoma funcional de alto rendimiento y reproducible.
• Este recurso avanza significativamente la capacidad de descubrir las funciones de los genes y sus contribuciones a varios fenotipos biológicos.
• El estudio destaca la utilidad del Haplobank en el descubrimiento de genes involucrados en procesos biológicos fundamentales y mecanismos de enfermedades.