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Un nuevo grupo de genes dentro del complejo de histocompatibilidad mayor humano
T Spies1, G Blanck, M Bresnahan
1Department of Biochemistry and Molecular Biology, Harvard University, Cambridge, MA 02138.
Resumen
Los investigadores identificaron cinco nuevos genes, denominados transcripciones asociadas a HLA-B (BAT), cerca de los genes del factor de necrosis tumoral (TNF) y HLA-B. Su ubicación sugiere un papel en la susceptibilidad a la espondilitis anquilosante.
Área de la Ciencia:
- Genética Humana Genética Humana.
- Biología Molecular Biología Molecular
- Inmunogenética La inmunogenética.
Sus antecedentes:
- La región del complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) humano contiene genes críticos para la función inmune, incluidos el HLA-B y los factores de necrosis tumoral (TNF).
- La base genética de la susceptibilidad a enfermedades como la espondilitis anquilosante, que está asociada con HLA-B, sigue siendo incompletamente entendida.
- Estudios previos sugirieron la presencia de genes no caracterizados dentro del MHC, centroméricos a HLA-B.
Objetivo del estudio:
- Para mapear físicamente y caracterizar nuevos genes ubicados dentro de un segmento de ADN centromérico de 435 kilobases (kb) al gen HLA-B.
- Para investigar la actividad transcripcional e identificar genes específicos dentro de esta región MHC.
- Explorar el papel potencial de los genes recién identificados en la susceptibilidad a la espondilitis anquilosante.
Principales métodos:
- Caminar del cromosoma usando clones cósmidos superpuestos para aislar un segmento de ADN de 435 kilobytes.
- Análisis de las islas CpG para predecir regiones ricas en genes.
- Análisis transcripcional utilizando sondas cósmidas en varias muestras de ARN de líneas celulares.
- Aislamiento de clones de ADN complementario (ADNc) para identificar nuevos genes.
Principales resultados:
- Se clonó con éxito un segmento de ADN centromérico de 435 kilobytes a HLA-B.
- Los genes para TNF alfa, TNF beta y HLA-B se localizaron dentro de esta región, con TNF alfa y beta a 210 kb de distancia.
- Se identificaron cinco nuevos genes, designados transcriptores asociados a HLA-B (BAT), dentro de una región de 160 kilobytes que abarca los genes TNF.
Conclusiones:
- El estudio identificó y mapeó con éxito cinco nuevos genes (BAT1-BAT5) en estrecha proximidad a los genes HLA-B y TNF.
- El descubrimiento de estos genes BAT amplía nuestra comprensión del complejo paisaje genético del MHC humano.
- La presencia de BAT1 y BAT5 cerca de HLA-B justifica una mayor investigación sobre su posible contribución a la patogénesis de la espondilitis anquilosante.