La proteómica química del ARN revela el interactoma de N6 metiladenosina (m6A) regulado por proteínas y ARN

Área de la Ciencia:

• La bioquímica
• Biología molecular
• Proteomía

Sus antecedentes:

• Las modificaciones epitranscriptómicas del ARN regulan la función del ARNm.
• Los mecanismos bioquímicos de los efectos de la modificación del ARN son poco conocidos.
• N6 - metiladenosina (m6A) es la modificación interna de ARN más abundante en los eucariotas.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un enfoque de proteómica química para perfilar las interacciones ARN-proteína reguladas por m6A.
• Para identificar las proteínas que interactúan con el ARN m6 modificado.
• Para aclarar los mecanismos bioquímicos de la función m⁶A.

Principales métodos:

• Desarrollo de una estrategia proteómica química.
• Utilizando el enlace cruzado con sondas de ARN sintéticas que contienen diazirina.
• Proteómica cuantitativa para perfilar las interacciones ARN-proteína.

Principales resultados:

• Se han identificado 6 interactores conocidos (proteínas del dominio YTH, ALKBH5).
• Descubrieron nuevos lectores m⁶A: FMR1 y LRPPRC, proteínas relacionadas con enfermedades humanas.
• Se encontró que m6A interrumpe la unión de ARN por las proteínas de gránulos de estrés (G3BP1/2, USP10, CAPRIN1, RBM42).

Conclusiones:

• El estudio presenta una estrategia general para interrogar los interactomas de modificación de ARN.
• Se han descubierto nuevos mecanismos bioquímicos subyacentes a la función m⁶A.
• Destacó el papel de m6A en la regulación de la dinámica de los gránulos de estrés y las interacciones de proteínas asociadas a la enfermedad.