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  • 1KU Leuven - University of Leuven, Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute, Herestraat 49, B-3000 Leuven, Belgium.

Nature
|November 17, 2017
PubMed
Resumen

El perfil cuantitativo del microbioma, utilizando recuentos en lugar de ratios, revela las variaciones de la carga microbiana y su impacto en la salud del huésped. Este método supera las limitaciones del perfil relativo, ofreciendo una visión más profunda de las interacciones de la microbiota intestinal y las asociaciones de enfermedades.

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Área de la Ciencia:

  • Investigación del microbioma
  • La microbiota intestinal
  • Interacciones huésped-micróbio

Sus antecedentes:

  • Los análisis actuales de la microbiota fecal utilizan perfiles relativos, lo que limita la comprensión de la interacción entre el huésped y los microbios.
  • Los enfoques relativos no pueden cuantificar la carga microbiana ni vincularla con los datos fisiológicos del huésped.
  • La abundancia microbiana alterada en sí misma puede indicar cambios en el ecosistema asociados a la enfermedad.

Objetivo del estudio:

  • Desarrollar un flujo de trabajo para el perfil cuantitativo del microbioma del material fecal.
  • Permitir una verdadera caracterización de las interacciones huésped-microbiota mediante el uso de recuentos microbianos.
  • Investigar el impacto de la carga microbiana en la salud y las enfermedades del huésped.

Principales métodos:

  • Paralelización de la secuenciación de amplicones y enumeración citométrica de flujo de células microbianas.
  • Perfiles cuantitativos del microbioma de las muestras fecales.
  • Análisis comparativo de los datos relativos y cuantitativos del microbioma.

Principales resultados:

  • Se observaron diferencias de hasta diez veces en las cargas microbianas entre individuos sanos, relacionadas con la diferenciación de enterotipo.
  • Se ha demostrado que las abundancias microbianas explican la variación de la microbiota y la covarianza del fenotipo del huésped.
  • Se identificó la carga microbiana como un factor clave de las alteraciones de la microbiota en pacientes con enfermedad de Crohn.

Conclusiones:

  • El perfil cuantitativo del microbioma es esencial para comprender las interacciones huésped-microbio más allá de la abundancia relativa.
  • La carga microbiana, no sólo la abundancia relativa, es crucial para caracterizar los ecosistemas intestinales y la salud.
  • Este enfoque supera las limitaciones del perfil relativo, revelando la verdadera dinámica microbiana y las asociaciones de enfermedades.