Análisis transcriptómico unicelular de ecosistemas tumorales primarios y metastásicos en cáncer de cabeza y cuello

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La genómica
• Biología celular

Sus antecedentes:

• La composición del microambiente tumoral, incluidas las células malignas, estromales e inmunes, influye en la progresión del cáncer y los resultados del tratamiento.
• El carcinoma de células escamosas de la cabeza y el cuello (HNSCC) es una enfermedad compleja en la que la heterogeneidad celular afecta el pronóstico del paciente.

Objetivo del estudio:

• Para analizar el ecosistema celular de HNSCC a una resolución de una sola célula.
• Para identificar programas celulares distintos dentro de los compartimentos malignos y estomales.
• Investigar el papel de la transición parcial epitelial a mesenquimal (p-EMT) en la metástasis del HNSCC y sus características clínicas.

Principales métodos:

• Secuenciación de ARN unicelular de aproximadamente 6.000 células de 18 pacientes con HNSCC, incluidos tumores primarios y metástasis en los ganglios linfáticos.
• Integración de los datos de una sola célula con los perfiles de expresión masiva de una cohorte más grande de tumores HNSCC.
• Análisis espacial de las células que expresan p-EMT dentro de los tejidos tumorales.

Principales resultados:

• Las células estomales e inmunes muestran patrones de expresión conservados en los pacientes con HNSCC.
• Las células malignas muestran una heterogeneidad significativa en las firmas de expresión relacionadas con el ciclo celular, el estrés, la hipoxia, la diferenciación y la p-EMT.
• Las firmas p-EMT se observaron predominantemente en el borde delantero de los tumores primarios.
• La p-EMT se identificó como un predictor independiente de la metástasis nodal, el grado tumoral y las características patológicas adversas.
• Subtipos refinados de HNSCC basados en la composición de las células malignas y del estroma.

Conclusiones:

• El perfilado de una sola célula proporciona información crítica sobre el ecosistema celular de HNSCC.
• Las interacciones estomales y el programa de p-EMT están significativamente asociadas con el potencial metastásico en HNSCC.
• Comprender la heterogeneidad celular y programas específicos como p-EMT puede refinar la clasificación de HNSCC e identificar objetivos terapéuticos.