Pasando de las asociaciones de todo el microbioma a la identificación de microbios causales

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• Inmunología
• Gastroenterología

Sus antecedentes:

• Los estudios de asociación de todo el microbioma relacionan los cambios en la microbiota intestinal con las enfermedades, pero a menudo carecen de conocimientos causales.
• Identificar los microbios específicos responsables de la patogénesis de las enfermedades sigue siendo un desafío.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y validar un método de triangulación del fenotipo microbiano para la identificación de los microbios causantes.
• Avanzar más allá de los estudios correlativos en la investigación del microbioma para establecer la causalidad.

Principales métodos:

• Se utilizaron ratones gnotobióticos con comunidades microbianas definidas en un modelo de colitis.
• Empleó experimentos de co-vivienda para crear microbiotas híbridos y evaluar fenotipos intermedios.
• Relaciones de fenotipo de microbios mapeadas en modelos de ratones parentales y híbridos.

Principales resultados:

• La triangulación de microbios-fenotipos redujo con éxito el ruido e identificó los microbios causantes.
• La familia bacteriana Lachnospiraceae se asoció con la protección contra la colitis.
• Descubrió y aisló Clostridium immunis, una nueva especie que confiere protección contra la colitis.

Conclusiones:

• La triangulación de microbios-fenotipos es una estrategia efectiva para identificar los microbios causales a partir de datos complejos de la microbiota.
• Este enfoque puede identificar organismos comensales que modulan los fenotipos del huésped, como la resistencia a las enfermedades y la inducción de péptidos antimicrobianos.
• El método tiene una amplia aplicabilidad para los estudios del microbioma humano para descubrir bacterias moduladoras de enfermedades.