Arquitectura genética del proteoma de riesgo cardiovascular

Área de la Ciencia:

• Genética y genómica
• Proteomía
• Investigación de las enfermedades cardiovasculares

Sus antecedentes:

• Se identificaron 156 proteínas plasmáticas humanas previamente relacionadas con el riesgo de enfermedad cardiovascular.
• El estudio tuvo como objetivo encontrar determinantes genéticos de estas proteínas asociadas al riesgo.

Objetivo del estudio:

• Identificar las variantes genéticas asociadas con los niveles plasmáticos de 156 proteínas asociadas con el riesgo de enfermedad cardiovascular.
• Explorar nuevas vías biológicas en la fisiopatología de las enfermedades cardiovasculares.
• Validar experimentalmente una nueva asociación genética con los niveles de apolipoproteína E.

Principales métodos:

• Se realizaron estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) y análisis de matrices de exomas en dos cohortes basadas en la población (Framingham Heart Study Offspring y Malmö Diet and Cancer Study).
• Se utilizaron modelos lineales de efectos mixtos para evaluar la asociación entre las variantes genéticas y los niveles de proteínas plasmáticas.
• Se utilizó un sistema de modelo celular para la validación experimental de una nueva asociación genética.

Principales resultados:

• Se identificaron 120 asociaciones locus-proteína de GWAS y 41 de análisis de matriz de exomas, muchas de las cuales no se habían descrito anteriormente.
• Estos loci genéticos explicaron hasta el 66% de la variación de las proteínas plasmáticas, significativamente más que los factores clínicos comunes.
• Se validó experimentalmente una asociación novedosa entre los niveles de apolipoproteína E y el factor de transcripción fosfatasa 1G, mostrando que la eliminación de la fosfatasa 1G disminuye la transcripción y los niveles de apolipoproteína E.

Conclusiones:

• Se descubrieron docenas de nuevos determinantes genéticos para las proteínas asociadas con el riesgo de enfermedad cardiovascular.
• Se confirmó experimentalmente una nueva función de la fosfatasa 1G en la biología de las lipoproteínas.
• Se proporcionan datos de matriz de genoma y exoma disponibles públicamente para cada proteína como un recurso para la investigación de enfermedades cardiovasculares.