Helix de transmembrana inclinada, ininterrumpida y monomérica VIH-1 gp41 de acoplamientos dipolares residuales

Área de la Ciencia:

• Biología estructural
• La biofísica
• Virología

Sus antecedentes:

• Estudios previos utilizando microscopía criolectrónica y cristalografía de rayos X sugirieron simetría C3 para los estados pre y postfusión del VIH- 1 gp41.
• Se modeló y apoyó experimentalmente una estructura homotrimérica para el dominio transmembrana (TM), lo que implica simetría C3.

Objetivo del estudio:

• Investigar la simetría estructural y el estado oligomérico del dominio transmembrana del VIH-1 gp41 (TM).
• Para conciliar los datos experimentales contradictorios con respecto a la estructura del VIH-1 gp41 TM.

Principales métodos:

• Acoplamientos dipolares residuales de resonancia magnética nuclear (RMR) bajo tres condiciones de alineación diferentes.
• Mejoramiento de la relajación paramagnética.
• Ultracentrifugado analítico
• Espectroscopía DEER EPR.
• Datos de relajación por RMN de 15N.

Principales resultados:

• Los CDR de RMN fueron incompatibles con la simetría C3 propuesta para el TM.
• La mejora de la relajación paramagnética, la ultracentrifugación analítica y el DEER EPR indicaron un estado monomérico para el TM.
• Los datos de relajación de RMN 15 y los RDC demostraron que la MT es altamente ordenada e ininterrumpida para 32 residuos, extendiéndose a la región externa proximal de la membrana.

Conclusiones:

• El VIH-1 gp41 TM no adopta una estructura simétrica C3.
• La TM es monomérica y altamente ordenada, con una porción significativa incrustada dentro de la membrana.
• Estos hallazgos desafían los modelos estructurales anteriores del VIH-1 gp41.