El genoma del axolotl y la evolución de los reguladores clave de la formación de tejidos

Área de la Ciencia:

• Biología del desarrollo
• La medicina regenerativa
• Biología evolutiva

Sus antecedentes:

• Las salamandras, particularmente el axolotl mexicano (Ambystoma mexicanum), son modelos cruciales para estudiar el desarrollo, la regeneración y la evolución.
• El axolotl mexicano posee un extenso conjunto de herramientas moleculares, lo que lo convierte en una especie clave para la investigación molecular.

Objetivo del estudio:

• Para secuenciar y ensamblar el genoma del axolotl mexicano de 32 gigabase.
• Investigar las bases genómicas de la regeneración y los procesos de desarrollo en los axolotl.

Principales métodos:

• Utilizó secuenciación de larga lectura y mapeo óptico.
• Desarrolló un nuevo ensamblador de genoma llamado MARVEL.
• Se analizó la expansión del tamaño del genoma, las regiones intrónicas / intergénicas y el contenido de genes.

Principales resultados:

• Secuenciado y ensamblado con éxito el genoma del axolotl grande.
• Se identificó una expansión significativa de intrones y regiones intergénicas, principalmente a partir de retroelementos de repetición terminal largos.
• Encontró evidencia de tamaños de intrones restringidos en genes de desarrollo e identificó genes potencialmente restringidos por especies vinculados a la regeneración de las extremidades.
• El ensamblaje del genoma del axolotl carece del gen Pax3, pero las mutaciones Pax7 fenocopian las deficiencias del ratón Pax3/Pax7.

Conclusiones:

• La secuencia del genoma del axolotl es un recurso valioso para estudios de desarrollo y evolución.
• Las ideas genómicas sobre la expansión intrónica y el contenido genético proporcionan nuevas vías para la investigación de la regeneración.