Análisis del genoma y del transcriptoma de 1.699 leucemias pediátricas y tumores sólidos

Área de la Ciencia:

• La genómica
• En el campo de la oncología
• Medicina pediátrica

Sus antecedentes:

• El análisis pancancer revela similitudes y diferencias moleculares en los cánceres adultos.
• Los cánceres pediátricos, que se originan en los tejidos en desarrollo, carecen de estudios genómicos pancancerígenos completos.
• La investigación existente se centra principalmente en los cánceres epiteliales en adultos.

Objetivo del estudio:

• Realizar un análisis pancancerológico de las aberraciones moleculares somáticas en leucemias pediátricas y tumores sólidos.
• Identificar las características genómicas comunes y distintas de los cánceres pediátricos.
• Establecer una arquitectura genómica para los cánceres pediátricos para informar el desarrollo de terapias de precisión.

Principales métodos:

• Secuenciación de todo el genoma, todo el exoma y el transcriptoma de 1.699 tumores pediátricos en seis histotipos.
• Marco analítico uniforme aplicado a diversos tipos de datos genómicos: SNV, indels, SVS, CNA, fusiones de genes y ITD.
• Identificación y análisis de las firmas mutacionales de todo el genoma.

Principales resultados:

• Se identificaron 142 genes impulsores en los cánceres pediátricos, con un 55% único en comparación con los cánceres en adultos.
• Las alteraciones del número de copias y las variantes estructurales constituyeron la mayoría (62%) de los eventos identificados.
• Descubrió once firmas mutacionales en todo el genoma, incluida una relacionada con la exposición a rayos UV en leucemias aneuploides.

Conclusiones:

• Los cánceres pediátricos poseen una arquitectura genómica distinta en comparación con los cánceres de adultos.
• Una proporción significativa de las mutaciones muestran transcripción alelo detectable y expresión alelo-específica.
• Los hallazgos subrayan la necesidad crítica de terapias de precisión específicas para el cáncer pediátrico.