Video Experimental Relacionado

Updated: Feb 13, 2026

Mapping Genome-wide Accessible Chromatin in Primary Human T Lymphocytes by ATAC-Seq

Mapping Genome-wide Accessible Chromatin in Primary Human T Lymphocytes by ATAC-Seq

Published on: November 13, 2017

Paisaje de accesibilidad de la cromatina en embriones humanos tempranos y su asociación con la evolución

Lei Gao¹, Keliang Wu², Zhenbo Liu¹

¹CAS Key Laboratory of Genome Sciences and Information, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, 100101 Beijing, China.

|March 13, 2018

Resumen

La accesibilidad de la cromatina se establece durante el desarrollo temprano humano, con OCT4 desempeñando un papel clave en la activación del genoma cigótico (ZGA). La edad del gen y la actividad del transposón también influyen en la dinámica de la expresión génica en los embriones tempranos.

Área de la Ciencia:

Biología del desarrollo
La epigenética
La genómica

Sus antecedentes:

El papel del paisaje regulador de la cromatina en la embriogénesis humana temprana es en gran medida inexplorado.
Comprender la dinámica de la regulación génica es crucial para los procesos de desarrollo.

Objetivo del estudio:

Investigar el establecimiento de la accesibilidad de la cromatina durante la embriogénesis temprana humana.
Explorar el papel de los factores de transcripción como el OCT4 en el desarrollo temprano y la activación del genoma cigótico (ZGA).
Comprender la relación entre la edad del gen, las características del promotor y el tiempo de expresión.

Principales métodos:

Se utilizó la secuenciación del sitio hipersensible DNase I (DHS) para mapear la accesibilidad de la cromatina.
Análisis de los motivos de unión OCT4 y su enriquecimiento.
Correlación de la edad del gen y el contenido de CpG promotor con el establecimiento de DHS y la expresión génica.

Principales resultados:

La accesibilidad a la cromatina se establece gradualmente durante la embriogénesis temprana humana.
Los motivos de unión OCT4 se enriquecen en ZGA en humanos, y OCT4 es crucial para ZGA humano, a diferencia de los ratones.
Los genes más jóvenes y los genes con promotores CpG más bajos están asociados con el establecimiento y la expresión posteriores de DHS, mientras que los genes más antiguos muestran patrones anteriores.
Los transposones humanos activos (SVA, HERV-K) albergan DHS y se expresan en embriones tempranos pero no en tejidos diferenciados.

Conclusiones:

Este estudio revela el establecimiento dinámico del paisaje cromatínico durante el desarrollo temprano humano.
El papel específico de OCT4 en ZGA destaca las diferencias evolutivas en la regulación del desarrollo.
La edad del gen y la actividad del transposón son factores significativos en la regulación de la expresión del gen y del transposón durante la embriogénesis, ofreciendo una perspectiva evolutiva del desarrollo.

Palabras clave:

El DHS Acceso a la cromatina La evolución Edad genética embriones humanos el transposón Activación del genoma cigótico

Más Videos Relacionados

The ChroP Approach Combines ChIP and Mass Spectrometry to Dissect Locus-specific Proteomic Landscapes of Chromatin

The ChroP Approach Combines ChIP and Mass Spectrometry to Dissect Locus-specific Proteomic Landscapes of Chromatin

Published on: April 11, 2014

Genome-wide Snapshot of Chromatin Regulators and States in Xenopus Embryos by ChIP-Seq

Genome-wide Snapshot of Chromatin Regulators and States in Xenopus Embryos by ChIP-Seq

Published on: February 26, 2015

Videos de Conceptos Relacionados

The Evidence for Evolution

The Evidence for Evolution

Genetic variations accumulating within populations over generations give rise to biological evolution. Evolutionary changes can result in the formation of novel varieties and entire new species. These changes are responsible for the diverse forms of life inhabiting the planet. The evidence for evolution suggests that all living organisms descended from common ancestors.

Chromatin Packaging

Chromatin Packaging

Each human somatic cell contains 6 billion base-pairs of DNA. Each base-pair is 0.34 nm long, which means that each diploid cell contains a staggering 2 meters of DNA. How is such a long DNA strand packed inside a nucleus measuring only 10 - 20 microns in diameter?
The chromatin
In combination with specialized DNA binding protein called Histones, the DNA double helix forms a compact DNA: protein complex called chromatin. The chromatin itself is further compacted into higher-order...

Inheritance of Chromatin Structures

Inheritance of Chromatin Structures

Epigenetics is the study of inherited changes in a cell's phenotype without changing the DNA sequences. It provides a form of memory for the differential gene expression pattern to maintain cell lineage, position-effect variegation, dosage compensation, and maintenance of chromatin structures such as telomeres and centromeres. For example, the structure and location of the centromere on chromosomes are epigenetically inherited. Its functionality is not dictated or ensured by the underlying...

Convergent Evolution

Convergent Evolution

Evolution shapes the features of organisms over time, ensuring that they are suited for the environments in which they live. Sometimes, selection pressure leads to the rise of similar but unrelated adaptations in organisms with no recent common ancestors, a process known as convergent evolution.

Chromatin Position Affects Gene Expression

Chromatin Position Affects Gene Expression

Chromatin is the massive complex of DNA and proteins packaged inside the nucleus. The complexity of chromatin folding and how it is packaged inside the nucleus greatly influences access to genetic information. Generally, the nucleus' periphery is considered transcriptionally repressive, while the cell's interior is considered a transcriptionally active area.
Topologically Associated Domains (TADs)
The 3-dimensional positioning of chromatin in the nucleus influences the...

Spreading of Chromatin Modifications

Spreading of Chromatin Modifications

The histone proteins in the nucleosomes are post-translationally modified (PTM) to increase or decrease access to DNA. The commonly observed PTMs are methylation, acetylation, phosphorylation, and ubiquitination of lysine amino acids in the histone H3 tail region. These histone modifications have specific meaning for the cell. Hence, they are called "histone code". The protein complex involved in histone modification is termed as "reader-writer" complex.
Writers
The writer...