La conformación del ADN induce un enlace adaptable por las proteínas del dedo de zinc en tándem

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• La genética
• Biología evolutiva

Sus antecedentes:

• Las proteínas tandémicas del dedo de zinc (ZF) representan la familia más grande y de más rápida evolución de los reguladores de transcripción de unión al ADN en los mamíferos.
• ZFP568 se ha identificado como un represor del transcrito del factor de crecimiento similar a la insulina específico de la placenta 2 (Igf2- P0) en ratones.

Objetivo del estudio:

• Para aclarar el mecanismo de unión al ADN de ZFP568.
• Investigar la dinámica estructural y la adaptabilidad evolutiva de las interacciones ZF-ADN.

Principales métodos:

• Análisis de la unión de ZFP568 a un elemento específico de 24 pares de bases situado aguas arriba de Igf2-P0.
• Examen de las conformaciones del ADN y de las proteínas durante la unión a la proteína ZF.

Principales resultados:

• ZFP568 utiliza una matriz de once ZF para unirse al elemento regulador Igf2-P0.
• Desviaciones observadas con respecto al reconocimiento convencional de ZF-ADN, con ZF individuales en contacto con un número variable de bases (2-4) y reconociendo timina en la hebra opuesta.
• Las interacciones menores de ranura acortadas debido a las secuencias ricas en AT resaltan la adaptabilidad de la matriz ZF.
• Las mutaciones en Igf2 y ZFP568 disminuyen la afinidad de unión en chimpancés y humanos, a pesar de la conservación en mamíferos.

Conclusiones:

• Las interacciones ZF-ADN exhiben flexibilidad conformacional, adaptándose a las variaciones de secuencia.
• Estos hallazgos proporcionan información crítica sobre la base evolutiva y estructural de las interacciones ZF-ADN en el desarrollo y la evolución de los mamíferos.