SLAM-seq define las funciones directas de regulación génica del eje BRD4-MYC

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Investigación del cáncer
• La genómica

Sus antecedentes:

• La comprensión de las funciones de los factores de transcripción en la fisiología y la enfermedad requiere la definición de objetivos moleculares directos.
• BRD4 y MYC son centros clave de transcripción implicados en el desarrollo y la progresión del cáncer.

Objetivo del estudio:

• Definir las funciones reguladoras de BRD4 y MYC.
• Para identificar objetivos transcripcionales directos de BRD4 y MYC.
• Para interrogar las respuestas directas a los inhibidores de la bromodomaína BET (BETis).

Principales métodos:

• SLAM-seq combinado (secuenciación metabólica de ARN) para la cuantificación directa de ARNm recién sintetizados.
• Estrategias de perturbación farmacológica y químico-genética.
• Análisis de la regulación transcripcional por BRD4 y MYC.

Principales resultados:

• BRD4 funciona como un coactivador general de la transcripción de la ARN polimerasa II, ampliamente reprimido por las dosis altas de BETis.
• BET desregula selectivamente un subconjunto de objetivos hipersensibles, incluyendo MYC, a dosis terapéuticas relevantes para la leucemia.
• El MYC actúa como un activador transcripcional selectivo, controlando principalmente los procesos metabólicos como la biogénesis ribosómica y la síntesis de purinas.

Conclusiones:

• BRD4 y MYC presentan funciones y respuestas transcripcionales distintas a los inhibidores de BET.
• SLAM-seq junto con la perturbación proporciona una estrategia escalable para identificar objetivos transcripcionales directos.
• Este enfoque puede dilucidar las funciones de los genes y las vías en varios contextos biológicos.