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Updated: Feb 11, 2026

Whole Genome Sequencing of Candida glabrata for Detection of Markers of Antifungal Drug Resistance
Published on: December 28, 2017
Un enfoque integrado de CRISPR a nivel genómico para funcionalizar los lncRNA en la resistencia a los medicamentos
Assaf C Bester1, Jonathan D Lee1, Alejandro Chavez2
1Cancer Research Institute, Beth Israel Deaconess Cancer Center, Department of Medicine and Pathology, Beth Israel Deaconess Medical Center, Harvard Medical School, Boston, MA, USA; Ludwig Center at Harvard, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
Este estudio introduce una nueva plataforma de detección CRISPR (DICaS) para encontrar genes que afectan la resistencia a los medicamentos contra el cáncer. Identificó nuevos genes de ciclo celular, supervivencia y señalización, incluido el GAS6-AS2 lncRNA, que contribuye a la resistencia a la quimioterapia en la LMA.
Área de la Ciencia:
- La genómica
- Biología molecular
- Investigación del cáncer
Sus antecedentes:
- La resistencia a la quimioterapia es una de las principales causas de mortalidad por cáncer.
- La citarabina es un tratamiento clave para la leucemia mieloide aguda (LMA).
- La identificación de factores genéticos que influyen en la sensibilidad a los medicamentos es crucial para mejorar la terapia contra el cáncer.
Objetivo del estudio:
- Desarrollar y aplicar una plataforma integral de detección de activación de CRISPR (DICaS) en todo el genoma para identificar los determinantes genéticos de la sensibilidad a la citarabina en el cáncer.
- Caracterizar funcionalmente tanto los genes de ARN codificantes de proteínas como los no codificantes largos (ARNlnc) involucrados en la resistencia a los medicamentos.
- Descubrir nuevos objetivos terapéuticos y mecanismos de resistencia en la LMA y otros tipos de cáncer.
Principales métodos:
- Desarrollo de una plataforma de detección integrada de activación de CRISPR (DICaS) con y sin doble codificación de proteínas.
- Identificación inicial de genes de presunta resistencia utilizando datos farmacogenéticos de 760 líneas de células pancancerosas humanas.
- Caracterización funcional de todo el genoma de la codificación y los genes lncRNA utilizando la activación de CRISPR, incluida una activación específica de CRISPR de la estrategia lncRNA (CaLR) para 14.701 genes lncRNA.
Principales resultados:
- DICaS identificó con éxito nuevos genes asociados con la regulación del ciclo celular, la supervivencia / apoptosis y las vías de señalización del cáncer.
- Se demostró que la activación transcripcional del lncRNA GAS6-AS2 identificado hiperactivaba la vía GAS6/TAM.
- Esta hiperactivación representa un mecanismo de resistencia significativo en múltiples cánceres, incluida la LMA.
Conclusiones:
- La plataforma DICaS es un enfoque potente e integrado para descubrir objetivos terapéuticos mediante el análisis de elementos genéticos codificantes y no codificantes.
- Los hallazgos destacan el papel de los lncRNA, como GAS6-AS2, en la mediación de la resistencia a la quimioterapia.
- Esta investigación proporciona nuevos conocimientos sobre la base genética de la resistencia a la citarabina y ofrece estrategias potenciales para superarla en la LMA y otras neoplasias malignas.
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