Coptación de repeticiones de ADN en tándem para el mantenimiento de la identidad mesenquimal

Área de la Ciencia:

• La genética
• Biología molecular
• Investigación del cáncer

Sus antecedentes:

• Las repeticiones en tándem (TR) son secuencias de ADN con alta inestabilidad debido a errores de replicación.
• Los TR suelen carecer de función en las redes reguladoras de genes.
• Los sitios de unión del factor de transcripción dentro de los TR pueden potencialmente conferir funciones reguladoras.

Objetivo del estudio:

• Investigar el papel de los TR en la regulación genética dentro de las células humanas.
• Determinar si los TR pueden ser exaptados en redes cis-reguladoras.
• Explorar la interacción entre ZEB1 y TRs para mantener la identidad celular.

Principales métodos:

• Análisis de la ocupación de ZEB1 en TRs en células humanas.
• Eliminación genómica de un TR específico en las células cancerosas cuasi-mesenquimales.
• Evaluación de los cambios de fenotipo celular después de la deleción de TR.

Principales resultados:

• ZEB1, un represor transcripcional, ocupa TRs que contienen su motivo de unión al ADN en loci críticos para la identidad epitelial.
• La eliminación de un TR específico en las células cancerosas condujo a la reacquisición de las características epiteliales.
• Este cambio fenotípico imitaba parcialmente los efectos de la deleción del gen ZEB1.

Conclusiones:

• Los motivos idénticos de alta densidad en los TR facilitan el reclutamiento de represores de transcripción como ZEB1.
• Las TR se pueden extraer en las redes cis-reguladoras existentes, contribuyendo a la regulación del genoma.
• Los TR juegan un papel importante en la plasticidad celular y el mantenimiento de la identidad epitelial.