El promotor del gen lncRNA PVT1 es un elemento límite de ADN supresor de tumores

Área de la Ciencia:

• La genética
• Biología molecular
• Investigación del cáncer

Sus antecedentes:

• Las mutaciones no codificantes son comunes en los genomas del cáncer pero difíciles de interpretar.
• El gen PVT1 codifica un ARN largo no codificante oncogénico (ARNlnc), pero las alteraciones genómicas asociadas al cáncer sugieren otras funciones.
• Los oncogenes PVT1 y MYC se encuentran muy próximos en el cromosoma 8q24.

Objetivo del estudio:

• Para investigar la función supresora del tumor del promotor PVT1, independiente del lncRNA PVT1.
• Aclarar la relación reguladora entre el promotor PVT1 y la expresión del oncogén MYC.
• Identificar el papel de las mutaciones del promotor PVT1 en el desarrollo del cáncer.

Principales métodos:

• Interferencia de CRISPR (CRISPRi) para inhibir la actividad del promotor PVT1.
• Análisis de la competencia de los promotores para los potenciadores compartidos.
• Secuenciación del genoma del cáncer y validación de la edición del genoma.

Principales resultados:

• La interferencia del promotor PVT1 aumentó la competencia de las células de cáncer de mama y el crecimiento in vivo.
• El promotor PVT1 compite con el promotor MYC por la interacción con los potenciadores intragénicos de PVT1.
• Esta competencia permite al promotor PVT1 regular la transcripción MYC a través de la liberación de la pausa.
• Se identificaron mutaciones del promotor PVT1 en los genomas del cáncer y se demostró que promueven el crecimiento de las células cancerosas.

Conclusiones:

• El promotor PVT1 posee una función supresora del tumor independiente del lncRNA PVT1.
• La competencia de promotores entre PVT1 y MYC es un mecanismo de regulación crítico.
• Las mutaciones en el promotor PVT1 contribuyen al desarrollo del cáncer.
• Las secuencias reguladoras de genes de lncRNA representan elementos de ADN potencialmente asociados a la enfermedad.