Los elementos de unión CTCF median la accesibilidad de los sustratos RAG durante el escaneo de cromatina

Área de la Ciencia:

• Inmunología
• Biología molecular
• La genética

Sus antecedentes:

• El ensamblaje de exones de la región variable de la cadena pesada de anticuerpos (V(D) J) es iniciado por la endonucleasa RAG en un centro de recombinación V(D) J (RC).
• La región de control de IGCR1 facilita la formación intermedia de DJ(H) secuestrando los elementos D, J(H) y RC de los segmentos V(H) aguas arriba a través de un bucle de cromatina anclado por elementos de unión CTCF (CBEs).

Objetivo del estudio:

• Investigar el mecanismo por el cual los segmentos V(H) acceden al DJ(H) RC para el reordenamiento de V(H) a DJ(H).
• Aclarar el papel de las CBE en la accesibilidad y el potencial de recombinación del segmento V (H).

Principales métodos:

• Se ha investigado la función de los CBE situados aguas abajo de las secuencias de señales de recombinación V (H) (RSS).
• Eficiencia de reordenamiento analizada V ((H) a DJ ((H) en presencia y ausencia de IGCR1 funcional.
• Utilizó un modelo de exploración de cromatina mediada por endonucleasa RAG y extrusión en bucle.

Principales resultados:

• Los CBE situados aguas abajo de las V(H) -RSS mejoran significativamente el potencial de recombinación de los segmentos V(H asociados más allá de la función RSS.
• Esta mejora mediada por CBE es particularmente pronunciada en la inactivación de IGCR1, revelando una función no anticipada de mejora de la accesibilidad de la cromatina.
• En ausencia de IGCR1, las CBE estabilizan las interacciones entre los segmentos D-proximales V ((H) encontrados durante el escaneo lineal de RAG, promoviendo su reordenamiento preferencial.

Conclusiones:

• Los CBE desempeñan un papel fundamental en la promoción de la accesibilidad del segmento V ((H) y la mejora de la recombinación V ((D) J.
• Los hallazgos revelan un mecanismo novedoso en el que las CBE facilitan el acceso de V{H} al DJ{H}RC, en particular en condiciones de función comprometida de IGCR1.
• Esto pone de relieve un papel inesperado para las EBC en la regulación de la reorganización genética de los anticuerpos a través de la modulación de la accesibilidad de la cromatina.