La helicasa Ded1p controla el uso de codones de iniciación de traducción casi cognados en las UTR de 5'

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• La genética
• La bioquímica

Sus antecedentes:

• Las helicasas de ARN DEAD-box Ded1p (levadura) y DDX3 (mamífero) son esenciales para el inicio de la traducción.
• La desregulación de DDX3 está implicada en el cáncer y las discapacidades intelectuales, y DDX3 es un objetivo para las infecciones virales.
• El mecanismo preciso por el cual Ded1p/DDX3 interactúa con el ARN durante la iniciación de la traducción sigue sin estar claro.

Objetivo del estudio:

• Para aclarar el papel de Ded1p en el compromiso del ARN durante la iniciación de la traducción.
• Para investigar el vínculo entre la actividad de Ded1p, la estructura del ARNm y el uso de codones de inicio alternativos.
• Comprender la relevancia fisiológica de este programa regulador en procesos como la meiosis.

Principales métodos:

• Análisis integrados de la traducción en todo el transcriptoma, la estructura del ARN y la unión al ARN Ded1p.
• Se evaluó el impacto de la represión de la actividad de Ded1p en la estructura del ARN de la región 5' no traducida (UTR) y la iniciación de la traducción.
• Los niveles de Ded1p examinados y la iniciación alternativa de la traducción durante la meiosis.

Principales resultados:

• Ded1p se asocia con el complejo de preiniciación de la traducción en el canal de entrada del ARNm.
• La represión de la actividad de Ded1p conduce a un aumento de la estructura de ARN en las UTR de 5', promoviendo la iniciación de la traducción desde los codones iniciales cercanos a la corriente.
• La represión de Ded1p resulta en una disminución de la síntesis de proteínas de los marcos de lectura principales abiertos y activa sitios alternativos de iniciación de la traducción durante la meiosis.

Conclusiones:

• Ded1p regula la iniciación de la traducción mediante el control de la selección de codones de inicio casi congénitos situados cerca de las estructuras de ARNm en las UTR de 5'.
• Un programa regulador que vincula a Ded1p, la activación del codón de inicio casi congénito y la estructura de ARNm gobiernan la síntesis de proteínas.
• Esta regulación mediada por Ded1p juega un papel importante en los procesos celulares, incluida la meiosis.