Dinámica conformacional diferencial codificada por el enlace entre los motivos de reconocimiento de cuasi ARN de la...

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Biología estructural
• La bioquímica

Sus antecedentes:

• Las proteínas F / H de ribonucleoproteína nuclear heterogénea (hnRNP) son proteínas de unión al ARN cruciales involucradas en el metabolismo del ARN.
• Estas proteínas comparten preferencias de secuencia de ARN similares, pero exhiben funciones celulares distintas.
• Su estructura de dominio modular incluye motivos de reconocimiento de cuasi-ARN en tándem N-terminal (qRRMs) y un qRRM3 C-terminal.

Objetivo del estudio:

• Investigar el impacto de un aminoácido vinculante específico (prolina en la posición 105) en la dinámica conformacional del dominio hnRNP H N-terminal (HqRRM1,2).
• Comparar las propiedades estructurales de los dominios terminales hnRNP H y hnRNP F N.

Principales métodos:

• Cristalografía de rayos X
• Espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN), incluida la dispersión de relajación de Carr-Purcell-Meiboom-Gill (CPMG)
• Diseminación de rayos X de ángulo pequeño (SAXS)

Principales resultados:

• El dominio HqRRM1,2 existe en un equilibrio conformacional entre estados compactos y extendidos.
• La estructura compacta HqRRM1,2 tiene una superficie electropositiva en la interfaz qRRM1-qRRM2.
• El dominio hnRNP F N-terminal (FqRRM1,2) adopta predominantemente una conformación más extendida y flexible en comparación con HqRRM1,2.
• Una mutación P105A en HqRRM1,2 cambió su dinámica hacia una estructura más extendida.

Conclusiones:

• La composición del vinculante influye significativamente en la dinámica estructural de las proteínas hnRNP F/H.
• Las diferencias conformacionales observadas entre hnRNP H y F probablemente contribuyen a sus distintas funciones funcionales en el metabolismo del ARN.
• La prolina en la posición 105 en hnRNP H es crítica para mantener una conformación más compacta.