Prevalencia de la reclasificación de variantes después de las pruebas genéticas de cáncer hereditario

Área de la Ciencia:

• La genética
• En el campo de la oncología
• Diagnóstico clínico

Sus antecedentes:

• La reclasificación de variantes es un aspecto crítico de las pruebas genéticas de cáncer hereditario.
• Existen datos limitados sobre la prevalencia y los patrones de reclasificación de las variantes.
• La clasificación precisa de la variante es esencial para el manejo del paciente y el asesoramiento genético.

Objetivo del estudio:

• Cuantificar la frecuencia y los tipos de reclasificación de variantes en las pruebas genéticas de cáncer hereditario.
• Evaluar el tiempo de presentación de los informes modificados tras la reclasificación de las variantes.
• Comprender las implicaciones de la reclasificación para la toma de decisiones clínicas.

Principales métodos:

• Estudio de cohorte retrospectivo de 1,45 millones de personas sometidas a pruebas genéticas entre 2006 y 2018 en un laboratorio comercial.
• Análisis de los informes de ensayo iniciales y de los informes modificados posteriores debido a la reclasificación de las variantes.
• Clasificación de las variantes en las categorías benigna, probablemente benigna, variante de importancia incierta, probablemente patógena o patógena.

Principales resultados:

• En general, el 6,4% de las variantes únicas fueron reclasificadas.
• La reclasificación de las variantes patógenas o benignas fue rara (0,7% y 0,2%, respectivamente).
• El 7,7% de las variantes únicas de importancia incierta (VUS) fueron reclasificadas, con la mayoría degradadas (91,2%) y una proporción menor mejorada (8,7%).
• Teniendo en cuenta todos los VUS reportados, el 24,9% fueron reclasificados, con un tiempo medio de informes modificados de 1,17 años para rebajas y 1,86 años para mejoras.

Conclusiones:

• Una proporción significativa (24,9%) de las variantes de importancia incierta se reclasifican con el tiempo, lo que implica tanto rebajas como mejoras.
• Estos hallazgos subrayan la naturaleza evolutiva de la interpretación de variantes en la genética del cáncer hereditario.
• Se necesita más investigación para evaluar la generalizabilidad y el impacto clínico de estas reclasificaciones.