Organización del genoma y control de la accesibilidad del ADN variación antigénica en los tripanosomas

Área de la Ciencia:

• La genética
• Biología molecular
• Parasitología

Sus antecedentes:

• Los organismos patógenos emplean la variación antigénica para evadir las respuestas inmunes del huésped.
• La variación antigénica se basa en grandes y diversos depósitos de genes de antígenos y en la expresión regulada.
• La arquitectura tridimensional del genoma y la accesibilidad del ADN influyen en la recombinación homóloga y la expresión génica.

Objetivo del estudio:

• Identificar los factores que vinculan la arquitectura tridimensional del genoma, la conformación de la cromatina y la variación antigénica.
• Para superar los desafíos en el ensamblaje de conjuntos de antígenos y genes repetitivos en patógenos como Trypanosoma brucei.

Principales métodos:

• Ensamblaje específico de haplotipo de matrices antígeno-gen usando secuenciación de larga lectura.
• Captura de la conformación cromosómica en todo el genoma (Hi-C) para analizar la partición del genoma.
• Fluorescencia in situ hibridación, ATAC-seq y secuenciación de ARN de una sola célula para evaluar la cromatina y la expresión génica.
• Investigando el papel de las variantes de histona H3.V y H4.V.

Principales resultados:

• Las regiones subteloméricas que codifican el antígeno en Trypanosoma brucei están organizadas en compartimentos compactos y distintos.
• La eliminación de las variantes de histona H3.V y H4.V promueve el agrupamiento antígeno-gen y aumenta la accesibilidad al ADN.
• La deleción de la variante histónica mejora la conmutación de la expresión de antígenos a través de la recombinación homóloga.

Conclusiones:

• Las variantes de histona H3.V y H4.V actúan como un enlace molecular entre la arquitectura del genoma, la conformación de la cromatina y la variación antigénica.
• Este hallazgo proporciona nuevos conocimientos sobre la regulación de las estrategias de evasión inmune en los patógenos.