Edición CRISPR predecible y precisa de las variantes patógenas

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• La reparación del ADN después de la escisión de Cas9 es típicamente aleatoria e impredecible.
• Esto limita su aplicación más allá de la simple interrupción de genes.

Objetivo del estudio:

• Para demostrar la edición predecible y precisa del genoma Cas9.
• Desarrollar un modelo de aprendizaje automático para predecir los resultados de la edición.

Principales métodos:

• Entrenó un modelo de aprendizaje automático, en Delphi, en 2.000 pares de sitios objetivo de ARN y ADN de guía Cas9.
• inDelphi predice los genotipos y las frecuencias de eliminación e inserción.
• Predicciones validadas en líneas celulares humanas y de ratón.

Principales resultados:

• inDelphi predice con precisión los resultados de la edición (r=0,87).
• Se han identificado ARN guía Cas9 que producen una edición precisa (precisa-50) en el 5-11% de los casos.
• Se corrigieron con éxito las mutaciones causantes de la enfermedad en células derivadas del paciente (síndrome de Hermansky-Pudlak, enfermedad de Menkes).

Conclusiones:

• La edición de Cas9 sin plantilla puede ser precisa y predecible.
• inDelphi permite una predicción precisa del genotipo para la edición del genoma.
• Este enfoque facilita la corrección precisa de las enfermedades genéticas.