La puntuación de riesgo de novo de todo el genoma implica variación del promotor en el trastorno del espectro autista

Área de la Ciencia:

• La genética
• La neurociencia
• La genómica

Sus antecedentes:

• La secuenciación de todo el genoma (WGS) permite la evaluación de las mutaciones de novo en trastornos complejos en todo el genoma.
• El trastorno del espectro autista (TEA) es una condición compleja de desarrollo neurológico con un componente genético significativo.

Objetivo del estudio:

• Evaluar la contribución de las mutaciones no codificantes de novo al trastorno del espectro autista (TEA).
• Identificar regiones no codificantes específicas y tipos de mutación asociados con el riesgo de TEA.

Principales métodos:

• Secuenciación del genoma completo (WGS) de 1902 familias cuartetas con un niño afectado y hermanos/padres no afectados.
• Análisis de 255.106 mutaciones de novo, centradas en las variantes no codificantes y las categorías de anotación funcional.
• Desarrollo de una puntuación de riesgo de novo que integre múltiples categorías de anotación.

Principales resultados:

• Ninguna categoría de anotación funcional no codificante se asoció significativamente con el TEA cuando se analizó de forma independiente.
• Un enfoque de puntuación de riesgo de novo reveló una asociación con mutaciones en las regiones promotoras.
• La señal más fuerte se originó en sitios de unión de factores de transcripción evolutivamente conservados distales al sitio de inicio de la transcripción.

Conclusiones:

• Las mutaciones de novo en las regiones promotoras, especialmente aquellas con firmas evolutivas y funcionales, contribuyen al TEA.
• La variación no codificante juega un papel en la etiología de los TEA, particularmente cuando se analiza en conjunto y dentro de elementos regulatorios específicos.