Identificación de elementos cis para el control espacio-temporal de la replicación del ADN de los mamíferos

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• La epigenética

Sus antecedentes:

• El tiempo de replicación (RT) está vinculado a la arquitectura del genoma, pero los elementos cis reguladores son desconocidos.
• Los dominios topológicamente asociados (TAD) son unidades estructurales clave del genoma.

Objetivo del estudio:

• Identificar los elementos cis que regulan el tiempo de replicación y la arquitectura del genoma.
• Investigar el papel de los límites del TAD y de los elementos intra-TAD en el control de estos procesos.

Principales métodos:

• Las deleciones e inversiones mediadas por CRISPR en los ESC de ratón.
• Análisis del tiempo de replicación, compartimentación A / B, arquitectura TAD y transcripción.

Principales resultados:

• Los límites TAD asociados a CTCF son prescindibles para el cronometraje de la replicación.
• La eliminación de sitios de contacto intra-TAD independientes del CTCF (ERCE) causó cambios de RT en todo el dominio, cambios de compartimento A a B, TAD debilitados y pérdida de transcripción.
• Los ERCE son esenciales para mantener la estructura y la función del genoma.

Conclusiones:

• Los elementos cis-reguladores discretos (ERCE) controlan el tiempo de replicación en todo el dominio, la compartimentación, la arquitectura TAD y la transcripción.
• Estos hallazgos revelan principios fundamentales que vinculan la estructura y la función del genoma.