Interrogatorio completo en vivo revela el impacto fenotípico de las variantes de potenciador humano

Área de la Ciencia:

• La genética
• Biología del desarrollo
• Medicina genómica

Sus antecedentes:

• La determinación de la patogenicidad de las variantes genéticas no codificantes es un desafío significativo en la genética humana.
• Los elementos potenciadores juegan un papel crucial en la regulación de los genes y están implicados en diversas enfermedades humanas.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y validar un ensayo de alto rendimiento en ratones in vivo para evaluar el impacto funcional de las variantes humanas de potenciadores.
• Evaluar sistemáticamente el potencial patógeno de las variantes de un potenciador asociado a la polidactilia.

Principales métodos:

• Se utilizó un ensayo de alto rendimiento en ratones para evaluar casi mil variantes de potenciadores humanos in vivo.
• Se utilizó la mutagénesis combinatoria y de un solo nucleótido para sondear el panorama funcional del potenciador.
• El fenotipo de polidactilia fue evaluado en ratones knockin portadores de variantes identificadas.

Principales resultados:

• El 71% de las variantes no codificantes raras propuestas anteriormente exhibieron patrones patógenos de expresión génica referente in vivo.
• Se confirmó que las variantes que alteran la actividad del potenciador causan polidactilia en modelos de ratón knockin.
• Se identificaron otras variantes funcionales y potencialmente patógenas, no observadas previamente en humanos.

Conclusiones:

• El estudio establece una estrategia sólida y ampliamente aplicable para la evaluación sistemática in vivo de las variantes de potenciadores humanos.
• Los hallazgos revelan las consecuencias funcionales de numerosas mutaciones dentro de un potenciador asociado al fenotipo.
• Este enfoque facilita el establecimiento de vínculos causales entre las variantes no codificantes y los fenotipos humanos.