Los análisis del microbioma de la sangre y los tejidos sugieren un enfoque de diagnóstico del cáncer

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• Investigación del microbioma
• La genómica

Sus antecedentes:

• La evidencia emergente sugiere un papel para los microorganismos en el desarrollo y la progresión del cáncer.
• El Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA) proporciona un recurso valioso para investigar las comunidades microbianas asociadas con el cáncer.
• Comprender el microbioma del cáncer ofrece potencial para nuevas estrategias de diagnóstico.

Objetivo del estudio:

• Caracterizar sistemáticamente las firmas microbianas en diversos tipos de cáncer utilizando datos TCGA.
• Evaluar el potencial de diagnóstico de los ácidos nucleicos microbianos en la sangre para la detección del cáncer.
• Evaluar la viabilidad de una herramienta de diagnóstico basada en el microbioma para la oncología.

Principales métodos:

• Análisis de datos de secuenciación de todo el genoma y todo el transcriptoma de 18.116 muestras de cáncer no tratadas en 33 tipos.
• Identificación y caracterización de lecturas microbianas tanto en el tejido tumoral como en la sangre del paciente.
• Aplicación de métodos estrictos de descontaminación para garantizar la exactitud de los datos.
• Validación de firmas microbianas basadas en sangre en cánceres en etapa temprana y en plataformas de ADN tumoral libre de células.
• Discriminación entre individuos sanos y pacientes con cáncer utilizando ácidos nucleicos microbianos derivados del plasma.

Principales resultados:

• Se identificaron firmas microbianas únicas en muestras de tejido y sangre dentro y entre la mayoría de los tipos de cáncer principales.
• Las firmas microbianas basadas en la sangre demostraron un valor predictivo en los cánceres en etapa temprana (Ia-IIc) y aquellos que carecen de alteraciones genómicas detectables.
• Incluso después de una extensa descontaminación (hasta el 92,3% de eliminación de datos), las firmas seguían siendo predictivas.
• Los ácidos nucleicos microbianos derivados del plasma permitieron la discriminación entre individuos sanos y pacientes con cáncer de próstata, pulmón y melanoma.

Conclusiones:

• El microbioma del cáncer alberga firmas únicas con un potencial de diagnóstico significativo.
• Los ácidos nucleicos microbianos en la sangre representan un biomarcador prometedor y no invasivo para la detección del cáncer.
• Se justifica una mayor investigación sobre el diagnóstico oncológico basado en el microbioma para explorar su utilidad clínica.