Bases estructurales de la degradación de las proteínas asociadas a la ER mediada por el complejo de la ubiquitina...

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Biología celular
• Biología estructural

Sus antecedentes:

• Las proteínas del retículo endoplasmático luminal mal plegadas se degradan a través de la degradación asociada a la ER (ERAD-L).
• ERAD-L incluye retrotranslocación en el citosol, ubiquitinación y degradación proteasómica.
• El complejo Hrd1 media ERAD-L, pero su mecanismo de retrotranslocación es poco conocido.

Objetivo del estudio:

• Para determinar la estructura del complejo Hrd1 activo.
• Para aclarar el mecanismo de retrotranslocación del sustrato durante ERAD-L.

Principales métodos:

• Análisis por cryo-microscopía electrónica (cryo-EM) de dos subcomplejos Hrd1.
• Los experimentos de enlace cruzado.
• Simulaciones de dinámica molecular.

Principales resultados:

• La estructura revela que Hrd3 y Yos9 forman un sitio de unión luminal para sustratos glucosilados.
• Hrd1 y Der1 forman dos "medios canales" con cavidades distintas y puertas laterales.
• Los datos estructurales y de simulación sugieren un mecanismo para la translocación del bucle polipéptido a través de la membrana ER.

Conclusiones:

• La estructura determinada proporciona información mecanicista sobre la retrotranslocación de ERAD-L.
• El complejo Hrd1 utiliza un sistema de canales único para la transferencia de sustrato desde el lumen ER al citosol.