Ligando los sitios funcionales de tirosina en las proteínas utilizando la química de intercambio de azufre y triazol

Área de la Ciencia:

• Biología Química
• Química orgánica
• Proteomía

Sus antecedentes:

• El ajuste de la reactividad de los electrófilos de azufre es crucial para la química de clics y el desarrollo de sondas químicas.
• Los métodos anteriores se basaban principalmente en grupos de salida de fluoruro (LG) para activar electrófilos de azufre en la modificación de proteínas.
• La química de intercambio de azufre-triazol (SuTEx) utiliza un LG de triazol para la sustitución nucleofílica en los sitios de la proteína tirosina.

Objetivo del estudio:

• Investigar la compatibilidad de la química de SuTEx para el descubrimiento de ligandos basados en fragmentos.
• Explorar modificaciones del grupo de aductos (AG) y LG con propiedades electrónicas variables.
• Evaluar el impacto de estas modificaciones en la solución y la actividad del proteoma.

Principales métodos:

• Modificación sistemática de los grupos adyutivos y de los grupos salientes de SuTEx.
• Evaluación de la reactividad electrofílica basada en las propiedades de donación y retirada de electrones.
• Aplicación de SuTEx modificado para la proteómica química para cuantificar los sitios de tirosina ligada.
• Investigación de la actividad del fragmento SuTEx en lisados celulares y células vivas.

Principales resultados:

• La reactividad de SuTEx es muy sensible a la posición de modificación (AG vs. LG).
• La reactividad ajustable permitió ajustes gruesos y finos en la actividad.
• Se identificaron aproximadamente el 30% de los sitios de tirosina en el 44% de las proteínas como ligados en más de 1500 sitios.
• Se logró la ligadura específica del sitio de la tirosina no catalítica y de los sitios de la fosfotirosina.

Conclusiones:

• SuTEx es una plataforma de química covalente versátil para el descubrimiento de ligandos basados en fragmentos.
• La química permite amplias aplicaciones en la proteómica química y la interrupción de la función de las proteínas.
• SuTEx ofrece un control preciso de la reactividad para la modificación de proteínas objetivo.