Reconstrucción rápida del SARS-CoV-2 utilizando una plataforma de genómica sintética

Área de la Ciencia:

• Virología
• Biología sintética
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• Los grandes genomas de virus de ARN plantean desafíos para la clonación y la manipulación tradicionales en Escherichia coli.
• Los sistemas de genética inversa existentes pueden ser engorrosos, lo que dificulta la investigación rápida y la respuesta a los brotes virales.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y validar una plataforma de genómica sintética rápida y robusta basada en levaduras para reconstruir diversos virus de ARN.
• Para permitir la manipulación genética eficiente y la caracterización de los virus de ARN, incluidos los coronavirus.

Principales métodos:

• Se utilizó Saccharomyces cerevisiae para el reensamblaje en un solo paso de fragmentos subgenómicos virales mediante la clonación por recombinación asociada a la transformación.
• Genomas virales generados como cromosomas artificiales de levadura.
• Empleó la ARN polimerasa T7 para producir ARN infeccioso para el rescate del virus.

Principales resultados:

• Se han reconstruido con éxito diversos virus de ARN de las familias Coronaviridae, Flaviviridae y Pneumoviridae.
• Clones de coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) diseñados y generados químicamente dentro de una semana de recibir ADN sintético.
• Demostró la capacidad de la plataforma para la generación en tiempo real y la caracterización funcional de las variantes de virus de ARN en evolución.

Conclusiones:

• La plataforma de genómica sintética basada en levaduras ofrece una herramienta poderosa y eficiente para la genética inversa del virus de ARN.
• Esta tecnología facilita respuestas rápidas a amenazas virales emergentes, ayudando en estudios de patogénesis y desarrollo de vacunas.
• La plataforma apoya la generación y el análisis de clones virales sintéticos, cruciales para comprender y combatir enfermedades virales como el COVID-19.