El marco común de coordenadas del cerebro del ratón Allen: un atlas de referencia en 3D

Área de la Ciencia:

• La neurociencia
• Biología computacional
• Cartografía del cerebro

Sus antecedentes:

• Las colaboraciones de investigación del cerebro de ratón a gran escala generan vastos conjuntos de datos multimodales.
• La integración de estos diversos conjuntos de datos requiere un atlas de referencia 3D estandarizado.

Objetivo del estudio:

• Introducir el Marco Común de Coordenadas del Cerebro del Ratón Allen versión 3 (CCFv3) como un atlas de referencia 3D estandarizado.
• Facilitar la integración y el análisis de datos cerebrales de ratón a gran escala.

Principales métodos:

• Se construyó un cerebro de plantilla promedio con una resolución voxel de 10 μm utilizando tomografía en serie de dos fotones de 1.675 ratones.
• Parcelado todo el cerebro en 3D utilizando datos de referencia multimodal, etiquetando cada voxel con una estructura cerebral específica.

Principales resultados:

• El CCFv3 proporciona una fragmentación 3D detallada del cerebro de ratón, que incluye 43 áreas isocorticales, 329 estructuras subcorticales, 81 tractos de fibra y 8 estructuras ventriculares.
• El atlas alcanza una resolución voxel de 10 μm, lo que permite un análisis espacial de grano fino.

Conclusiones:

• El Allen Mouse Brain CCFv3 sirve como un recurso crucial para analizar, visualizar e integrar conjuntos de datos de cerebro de ratón multimodal y multiscala.
• El CCFv3 es de acceso abierto y promueve la investigación colaborativa en neurociencia.